現(xiàn)代微生物遺傳學(xué)（二版）

第一章 微生物的遺傳物質(zhì)
第一節(jié) 證明遺傳物質(zhì)是DNA（有時(shí)是RNA）的經(jīng)典實(shí)驗(yàn)
一、細(xì)菌的轉(zhuǎn)化
二、噬菌體感染實(shí)驗(yàn)
三、病毒重建實(shí)驗(yàn)
第二節(jié) DNA的結(jié)構(gòu)和復(fù)制
一、DNA的結(jié)構(gòu)
二、DNA的復(fù)制特點(diǎn)和幾種主要復(fù)制方式
第三節(jié) 原核生物染色體及其復(fù)制
一、原核生物染色體數(shù)目和大小
二、細(xì)菌染色體的結(jié)構(gòu)
三、細(xì)菌染色體的復(fù)制
四、細(xì)菌染色體的分離機(jī)制
第四節(jié) 真核生物染色體及其復(fù)制
一、真核生物染色體的組成和結(jié)構(gòu)
二、真核生物染色體的復(fù)制
第五節(jié) 基因結(jié)構(gòu)和基因組
一、基因結(jié)構(gòu)和基因概念的發(fā)展
二、基因組學(xué)
三、大腸桿菌的基因組
四、X174噬菌體的基因組
五、真核生物的基因組及其特點(diǎn)
主要參考文獻(xiàn)
第二章 基因突變和損傷DNA的修復(fù)
第一節(jié) 基因突變的類型、符號和規(guī)律
一、基因的符號
二、基因突變的類型
三、遺傳學(xué)上常用的幾個(gè)突變株
四、基因突變的規(guī)律
第二節(jié) 基因突變的分子基礎(chǔ)
一、堿基置換及其對遺傳信息的影響
二、移碼突變及其產(chǎn)生
三、缺失和重復(fù)
第三節(jié) 誘變劑和誘變機(jī)制
一、堿基類似物在DNA復(fù)制時(shí)的摻入
二、DNA分子上堿基的化學(xué)修飾
三、嵌合劑和移碼突變
四、輻射誘變
第四節(jié) 自發(fā)突變和適應(yīng)突變
一、突變的自發(fā)性的證實(shí)
二、自發(fā)突變的機(jī)制
三、適應(yīng)突變（adaptive mutation）
第五節(jié) 損傷DNA的修復(fù)
一、光修復(fù)（photoreactivation）
二、錯(cuò)配修復(fù)（mismatch repair system）
三、切除修復(fù)（excision repair）
四、重組修復(fù)（recombination repair）
五、交聯(lián)修復(fù) （repair of interstrand crosslinks in DNA）
六、SOS修復(fù)
七、鏈斷裂的修復(fù)
主要參考文獻(xiàn)
第三章 病毒遺傳分析
第一節(jié) T噬菌體
一、T噬菌體的形態(tài)結(jié)構(gòu)
二、T噬菌體的基因組和遺傳圖譜
三、研究噬菌體感染的方法
四、重組測驗(yàn)（recombination test）
第二節(jié) λ噬菌體
一、λ噬菌體的生活周期
二、λ噬菌體基因組
三、λ噬菌體的復(fù)制
四、λ噬菌體基因的轉(zhuǎn)錄和調(diào)控
五、溶源途徑和裂解途徑的遺傳調(diào)控
六、λ噬菌體的溶源化和誘導(dǎo)
第三節(jié) 反轉(zhuǎn)錄病毒
一、反轉(zhuǎn)錄病毒的毒粒結(jié)構(gòu)
二、反轉(zhuǎn)錄病毒的生活周期
三、反轉(zhuǎn)錄病毒的基因組
四、反轉(zhuǎn)錄過程中DNA雙鏈的合成和LTR的產(chǎn)生
五、病毒線性DNA整合到寄主細(xì)胞基因組
六、原病毒的基因表達(dá)
主要參考文獻(xiàn)
第四章 細(xì)菌基因轉(zhuǎn)移和基因重組
第一節(jié) 轉(zhuǎn)化
一、自然轉(zhuǎn)化
二、人工轉(zhuǎn)化
三、利用轉(zhuǎn)化繪制遺傳圖
第二節(jié) 接合作用
一、接合現(xiàn)象的發(fā)現(xiàn)與證實(shí)
二、F質(zhì)粒的結(jié)構(gòu)及其在細(xì)胞中的存在狀態(tài)
三、F質(zhì)粒與接合作用
四、中斷雜交試驗(yàn)和基因定位
五、其他細(xì)菌中的接合作用
第三節(jié) 轉(zhuǎn)導(dǎo)
一、普遍性轉(zhuǎn)導(dǎo)
二、局限性轉(zhuǎn)導(dǎo)
主要參考文獻(xiàn)
第五章 質(zhì)粒
第一節(jié) 質(zhì)粒的發(fā)現(xiàn)和命名
一、質(zhì)粒的發(fā)現(xiàn)
二、質(zhì)粒的命名原則
第二節(jié) 質(zhì)粒編碼的遺傳表型
一、致育質(zhì)粒
二、抗藥性質(zhì)粒
三、產(chǎn)生抗生素的質(zhì)粒和產(chǎn)生細(xì)菌素的質(zhì)粒
四、產(chǎn)生毒素的質(zhì)粒
五、降解質(zhì)粒
六、致病性質(zhì)粒
七、共生固氮質(zhì)粒
八、隱蔽質(zhì)粒
第三節(jié) 質(zhì)粒的檢測
一、質(zhì)粒消除
二、遺傳轉(zhuǎn)移
三、分子雜交
四、質(zhì)粒的分離、檢測與純化
第四節(jié) 質(zhì)粒的復(fù)制和調(diào)節(jié)
一、質(zhì)粒的大小和拷貝數(shù)
二、質(zhì)粒的復(fù)制
三、質(zhì)粒復(fù)制的調(diào)控
四、質(zhì)粒之間的不相容性
五、質(zhì)粒的穩(wěn)定性（細(xì)胞分裂中的質(zhì)粒分配）
六、質(zhì)粒的轉(zhuǎn)移性
七、IncP組質(zhì)粒的特征和接合轉(zhuǎn)移
八、廣寄主范圍質(zhì)粒載體
九、F質(zhì)粒與細(xì)菌人工染色體（BAC）
主要參考文獻(xiàn)
第六章 微生物中的轉(zhuǎn)座因子
第一節(jié) 細(xì)菌轉(zhuǎn)座因子的類型和結(jié)構(gòu)
一、插入序列
二、細(xì)菌轉(zhuǎn)座子
三、細(xì)菌轉(zhuǎn)座因子的插入機(jī)制、轉(zhuǎn)座模型
四、Mu噬菌體的轉(zhuǎn)座
五、細(xì)菌接合型轉(zhuǎn)座子（conjugative transposon）
第二節(jié) 細(xì)菌轉(zhuǎn)座因子的遺傳效應(yīng)和應(yīng)用
一、轉(zhuǎn)座因子的遺傳效應(yīng)
二、轉(zhuǎn)座子的應(yīng)用
第三節(jié) 絲狀真菌中的轉(zhuǎn)座因子
一、 絲狀真菌中的轉(zhuǎn)座現(xiàn)象
二、絲狀真菌中的轉(zhuǎn)座因子類型
第四節(jié) 酵母中的轉(zhuǎn)座因子
一、Ty因子在酵母基因組中的分布情況
二、Ty因子的分子結(jié)構(gòu)和轉(zhuǎn)錄
三、Ty因子的轉(zhuǎn)座機(jī)制
四、Ty因子轉(zhuǎn)座的遺傳效應(yīng)
主要參考文獻(xiàn)
第七章 放線菌遺傳
第一節(jié) 鏈霉菌的染色體
一、鏈霉菌的染色體DNA
二、鏈霉菌染色體的缺失、擴(kuò)增和重排
第二節(jié) 鏈霉菌中的質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座因子和噬菌體
一、鏈霉菌中的質(zhì)粒
二、鏈霉菌中的轉(zhuǎn)座因子
三、鏈霉菌中的噬菌體
第三節(jié) 鏈霉菌的接合作用
一、鏈霉菌基因重組的發(fā)現(xiàn)
二、天藍(lán)色鏈霉菌中的性別體制和遺傳重組
三、鏈霉菌的遺傳分析方法和基因連鎖圖的制作
四、鏈霉菌與大腸桿菌之間的接合作用
第四節(jié) 鏈霉菌的轉(zhuǎn)化和原生質(zhì)體融合
一、原生質(zhì)體融合
二、轉(zhuǎn)化和轉(zhuǎn)染
主要參考文獻(xiàn)
第八章 酵母菌遺傳
第一節(jié) 酵母菌的基因組和染色體
一、酵母菌的基因組
二、酵母菌的染色體結(jié)構(gòu)
第二節(jié) 酵母線粒體基因組及其遺傳
一、呼吸缺陷突變株
二、酵母線粒體基因組的物理圖譜及其特點(diǎn)
第三節(jié) 酵母菌中的質(zhì)粒
一、2μm質(zhì)粒
二、嗜殺現(xiàn)象
第四節(jié) 酵母基因表達(dá)的調(diào)控
一、酵母基因的啟動(dòng)子元件
二、酵母的轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子
第五節(jié) 接合型基因及其基因型轉(zhuǎn)換
一、釀酒酵母的生活史
二、釀酒酵母細(xì)胞分裂的遺傳控制
三、接合型基因的轉(zhuǎn)換
第六節(jié) 酵母菌的載體系統(tǒng)
一、克隆載體
二、酵母菌的表達(dá)載體（YXp）
三、酵母菌的分泌載體（YSp）
第七節(jié) 酵母雙雜交系統(tǒng)
一、酵母雙雜交系統(tǒng)原理
二、酵母雙雜交系統(tǒng)的組成和特點(diǎn)
三、酵母雙雜交系統(tǒng)的應(yīng)用
主要參考文獻(xiàn)
第九章 絲狀真菌的遺傳
第一節(jié) 粗糙脈孢菌（順序排列四分體）的遺傳分析
一、粗糙脈孢菌的生活史
二、粗糙脈孢菌有性雜交的四分體遺傳分析
三、粗糙脈孢菌有性雜交的隨機(jī)孢子分析
第二節(jié) 構(gòu)巢曲霉（非順序排列四分體）的遺傳分析
一、構(gòu)巢曲霉的生活史
二、構(gòu)巢曲霉有性雜交的遺傳分析
第三節(jié) 真菌的準(zhǔn)性生殖
一、準(zhǔn)性生殖的普遍性
二、準(zhǔn)性生殖的過程
第四節(jié) 絲狀真菌的遺傳物質(zhì)和基因表達(dá)調(diào)控
一、基因組結(jié)構(gòu)
二、基因結(jié)構(gòu)
三、基因表達(dá)的調(diào)控
第五節(jié) 絲狀真菌中的質(zhì)粒
一、絲狀真菌中的天然質(zhì)粒及其分布
二、質(zhì)粒的類型和特征
三、質(zhì)粒的遺傳
四、質(zhì)粒整合到mtDNA
第六節(jié) 絲狀真菌的轉(zhuǎn)化及其特點(diǎn)
一、外源DNA導(dǎo)入絲狀真菌的方法
二、載體及其選擇標(biāo)記
三、絲狀真菌轉(zhuǎn)化子的表達(dá)及其穩(wěn)定性
主要參考文獻(xiàn)
第十章 原核生物基因表達(dá)的調(diào)控
第一節(jié) 概述
一、操縱子
二、阻遏物和激活物
三、負(fù)調(diào)控和正調(diào)控（negative and positive regulation）
四、誘導(dǎo)物和共阻遏物（inducer and corepressor）
第二節(jié) 轉(zhuǎn)錄水平的調(diào)控
一、細(xì)菌的RNA聚合酶
二、啟動(dòng)子
三、轉(zhuǎn)錄過程
四、σ因子與轉(zhuǎn)錄起始調(diào)控
五、轉(zhuǎn)錄的終止和抗終止
第三節(jié) 操縱子類型
一、大腸桿菌乳糖操縱子的正調(diào)控和負(fù)調(diào)控
二、半乳糖操縱子的雙重調(diào)控
三、阿拉伯糖操縱子的雙重調(diào)控
四、色氨酸操縱子的弱化作用
第四節(jié) 轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控
一、SD序列與翻譯效率
二、重疊基因?qū)Ψg的影響
三、嚴(yán)緊反應(yīng)
四、反義RNA的調(diào)控作用
主要參考文獻(xiàn)
第十一章 微生物的固氮調(diào)節(jié) 機(jī)制
第一節(jié) 固氮菌的種類
一、自生固氮菌
二、聯(lián)合固氮菌
三、共生固氮菌
第二節(jié) 生物固氮作用
一、固氮酶的結(jié)構(gòu)
二、固氮酶催化機(jī)制
第三節(jié) 肺炎克氏桿菌固氮基因表達(dá)的調(diào)控機(jī)制
一、固氮基因的結(jié)構(gòu)
二、nif基因啟動(dòng)子及其轉(zhuǎn)錄特點(diǎn)
三、銨和氧對NifA蛋白合成和NifA活性的調(diào)控
第四節(jié) 根瘤菌固氮基因表達(dá)調(diào)控
一、根瘤菌中的結(jié)瘤基因
二、根瘤菌中的固氮基因
主要參考文獻(xiàn)
第十二章 微生物的耐鹽機(jī)制
第一節(jié) 嗜鹽微生物
一、中度嗜鹽菌和極端嗜鹽菌的種類
二、Na+對嗜鹽菌的影響
第二節(jié) 微生物的鹽適應(yīng)機(jī)制
一、滲透調(diào)節(jié)
二、Na+輸出系統(tǒng)
第三節(jié) 嗜鹽菌的應(yīng)用
一、農(nóng)業(yè)中的應(yīng)用
二、工業(yè)中的應(yīng)用
三、環(huán)境修復(fù)中的應(yīng)用
主要參考文獻(xiàn)
第十三章 遺傳重組
第一節(jié) 遺傳重組的類型
一、同源重組
二、位點(diǎn)特異性重組
三、異常重組
第二節(jié) 同源重組的分子模型
一、Holliday 雙鏈侵入模型
二、單鏈侵入模型（MeselsonRadding模型）
三、雙鏈斷裂修復(fù)模型（Szostak模型）
第三節(jié) 大腸桿菌的同源重組
一、同源重組的起始 （RecBCD核酸酶）
二、鏈侵入、同源配對和Holliday結(jié)構(gòu)的形成（RecA蛋白質(zhì)）
三、異源雙鏈的擴(kuò)展（RuvAB）
四、Holliday 連接體的切割
第四節(jié) 釀酒酵母的同源重組
一、減數(shù)分裂重組
二、有絲分裂重組
第五節(jié) 同源重組的應(yīng)用
第六節(jié) 位點(diǎn)特異性重組
一、λ噬菌體的整合和切除
二、酵母2μm質(zhì)粒的位點(diǎn)特異性重組
三、P1噬菌體的位點(diǎn)特異性重組
四、同源重組與位點(diǎn)特異性重組的區(qū)別
第七節(jié) 異常重組
一、互補(bǔ)末端的連接
二、非互補(bǔ)末端的連接
主要參考文獻(xiàn)