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內(nèi)容簡介

　　高通量測序已成為生物學(xué)研究的重要手段，在生物多樣性、物種種質(zhì)資源開發(fā)利用和生物醫(yī)藥領(lǐng)域都發(fā)揮了非常重要的作用，因此，如何處理和分析高通量測序數(shù)據(jù)成為生物學(xué)研究的必備技能之一。《基于高通量測序的基因組分析》以高通量測序數(shù)據(jù)在基因組分析中的運(yùn)用為例，采用分步講解的方式，圖文并茂地介紹了高通量測序數(shù)據(jù)的基本格式，利用高通量測序數(shù)據(jù)開展分析的流程、相關(guān)程序，程序執(zhí)行過程及其分析注意事項(xiàng)。同時，對于數(shù)據(jù)分析運(yùn)算中的一些中間結(jié)果，作者提供了自己編寫的程序，以利于獲得*終結(jié)果?！痘诟咄繙y序的基因組分析》提供了Linux操作系統(tǒng)安裝方法，并基于Linux語言命令介紹了高通量測序數(shù)據(jù)處理過程，其中沒有復(fù)雜的程序代碼，不需要編程語言基礎(chǔ)，淺顯易懂，具有很強(qiáng)的實(shí)踐操作性。

作者簡介

暫缺《基于高通量測序的基因組分析》作者簡介

圖書目錄

目錄
第一章　Linux系統(tǒng)安裝　1
第二章　Linux基本命令　6
第三章　高通量測序數(shù)據(jù)的常見格式　12
第四章　基因組組裝　15
第一節(jié)　基因組大小估測　15
第二節(jié)　基于PacBio HiFi模式測序數(shù)據(jù)的基因組組裝　21
第三節(jié)　基于PacBio CLR模式測序數(shù)據(jù)的基因組組裝　27
第四節(jié)　基于Nanopore測序數(shù)據(jù)的基因組組裝　30
第五節(jié)　去除基因組中的冗余序列　37
第六節(jié)　Hi-C組裝　47
第五章　重復(fù)序列查找　66
第六章　基因預(yù)測　72
第七章　基因家族擴(kuò)張和收縮　82
第八章　物種歷史動態(tài)　100
第九章　群體重測序個體的SNP查找　110
第十章　遺傳多樣性參數(shù)計(jì)算　124
第十一章　受選擇作用的SNP位點(diǎn)　129
第一節(jié)　PCAdapt分析　129
第二節(jié)　BayPass分析　135
第三節(jié)　合并PCAdapt和BayPass結(jié)果　140
第十二章　遺傳結(jié)構(gòu)分析　144
第一節(jié)　PCA分析　144
第二節(jié)　Admixture分析　146