陳于陛，字元忠，大學士陳以勤的兒子。隆慶二年(1568)的進士。選任庶吉士，授職為編修。萬歷初年，參與編修世宗、穆宗兩朝的實錄，擔當日講官。調任侍講學士，晉升為詹事，負責翰林院。奏請皇帝早日建立東宮。萬歷十九年(1591)，任命為禮部右侍郎，掌管詹事府的事務。第二年改任吏部職，晉升左侍郎，教導庶吉士。奏稱嫡長子不應該分封為王，奏請及時冊立太子以便儲君的培養(yǎng)，并請求皇帝早上臨朝處理政務，都沒有答復。他又在第二年晉升為禮部尚書，仍然負責詹事府的事務。

　　陳于陛從小跟隨父親學習國家的歷史。做了史官，更加研究經邦濟世的學問。因為前代都撰修了國史，奏疏說：“我考察史學家的方法，紀、表、志、傳稱為正史。宋代距離我朝較近，制度更加可以考究。真宗祥符年間，王旦等人撰修呈獻太祖，太宗兩朝的正史。仁宗天圣年間，呂夷簡等人增補了真宗朝，命名為《三朝國史》。這就是當朝的君臣自己撰修當朝正史的明顯例證。我朝的史籍，只有列圣的實錄，正史空缺不講。觀看朝野的撰書，可供采選不用考慮的就有數百種。倘若不及時收集，歲月久遠，卷帙散失脫落，老人漸漸去世，事跡缺乏論據。想成為信史，將不可能求得。只有陛下馬上頒布明令，設館局編輯，使一代的經籍制度、典章，顯然可以考察，鴻謀偉烈，光照天地，難道不是萬世不朽的盛事嗎？”詔令依從他。萬歷二十二年(1594)三月，便命令詞臣分類編纂，由陳于陛和尚書沈一貫、少詹事馮琦擔任副總裁，而內閣大臣任總裁。

　　當年夏季，首輔王錫爵辭職，于是任命陳于陛兼任東閣大學士入閣參與機要事務。上奏陳述要皇帝親近大臣、錄用遺老賢士、獎勵京城之外的官吏、核查邊關糧餉、儲蓄將才、選任邊防官吏等六件事。最后說：“肅皇帝雖然精明，而末年卻貪贓瀆職成風，邊疆多事，是厭倦勤政的緣故?，F在皇上一方操持，百職不修行，不趕緊圖謀更新，往后將怎能平安？”皇帝下優(yōu)詔答復他，卻不采用他的建議?；实垡攒娬Р鞛槊?，斥責了兩都三十多名言官。陳于陛與同官一再申訴救助，并單獨奏疏請求皇帝寬恕，都不接納。因甘肅擊敗賊民的功績，加封為太子少保。乾清、坤寧兩宮遭災，奏請面奏皇上，沒有答復。請求罷免自己官職，皇帝也不同意。當年秋季，二品的考績滿了三年，改任文淵閣職責，晉升為太子太保。

　　當時內閣的四個人，趙志皋、張位、沈一貫與陳于陛都是同年出生，遇事彼此沒有齟齬。但是皇帝拒絕勸諫更加嚴重，上下彼此隔膜。陳于陛憂形于色，因不能進行補救，在供職的地方多次注視日影嘆息。萬歷二十四年(1596)冬季，病逝在職任上，史籍之事也最終作罷。贈封少保，謚號文憲。整個明代，父子任過宰輔的，只有南充的陳氏。